我馆的特藏资源已形成了以四库系列、民国时期的丛书和报纸影印系列、佛学藏书系列、地方文献系列为主题的特色馆藏。具体珍藏的主要有：

1、大型丛书：《四库全书》、《续修四库全书》、《四库禁燬书丛刊、补编》、《四库未收书辑刊》、《四库全书荟要》、《四部丛刊初编、续编、三编》、《丛书集成初编、续编》、《古今图书集成》、《民国丛书》、《清代诗文集汇编》、《古本小说集成》、《中国华东文献丛书》、《云南丛书》、《四明丛书》、《闽刻珍本丛书》、《明实录》、《清实录》、《清代方略全书》、《天一阁藏明代方志选刊、续编》、《稀见中国地方志汇刊》、《中国地方志集成▪浙江府县志辑、江苏府县志辑、上海府县志辑》、《地方经籍志汇编》、《全宋文》、《美国哈佛大学哈佛燕京图书馆藏中文善本汇刊》、《沿海形势及海防》、《中国海疆旧方志》、《中国海疆文献续编》、《中国古代历史图谱》、《中国古代海岛文献地图史料汇编》、《韩国儒学编》、《历代书画录辑刊、续编》、《琴曲集成》等

2、线装古籍：线装古籍共271种，2242册（1912年前刊印：164种，1443册；民国时期刊印：107种，799册）。主要有：明刻明清递修本《五代史记》；康熙版：《王先生十七史蒙求》、《尔雅注》；乾隆版：《廿一史弹词注》、《古文眉诠》、《阴阳二宅全书》；雍正版：《古文雅正》；同治版：《钦定四库全书总目》；光绪版：《佩文韵府》、《东华录》。台州地方文献方面主要有：《[光绪]台州府志》、《[民国]台州府志》、《[民国]临海县志稿》、《[光绪]黄岩县志》、《天台山方外志》、《临海要览》、《四休堂丛书》、《三台闺范》。其中刊于清乾隆十九年的《阴阳二宅全书》，被确认为浙江省珍贵古籍名录。

  3、珍贵报刊：报纸主要有：《申报》、《益世报》、《民国日报》（1916-1928）、《大公报》（1917-1927）、《晨报》（1916-1928）、《新华日报》（1939-1947）《民国教育公报汇编》、《外交报汇编》；杂志主要有：《北洋画报》（1926-1937）、《良友画报》（1926-1945）、《东方杂志》、《新青年》、《国风报》、《民报》、《清议报》、《中和月刊》、《燕京学报》、《小说月报》等。

4、佛学：《赵城金藏》、《乾隆大藏经》、《高丽大藏经》、《大正新修大藏经》、《大藏新纂卐续藏经》、《天台藏》、《中国灯录全书》、《日本密宗大典》、《中国佛寺志丛刊》、《禅宗大典》、《唯识文献全编》、《民国佛教期刊文献集成正编、补编、三编》、《稀见民国佛教文献汇编》、《新编世界佛学名著译丛》、《民国因明文献研究丛刊》、《现代佛教学术丛刊》、《海潮音》、《印度文明大系》等。

 5、地方文献：主要有《民国台州府志》、《台州丛书甲集、乙集》、《仙居丛书》、《台州外书》、《台学统》、《嘉定赤城志》、《温岭丛书甲集》、《赤城新志》、《天台山全志》、《台州札记》、《风雅遗闻》、《天台山记》、《赤城集》、《赤城遗书汇刊》等。